生物信息学一些基本的常用软件有哪些？序列拼接软件：velvet ， SOAPdenvoo ， SSAKE ， ABySS ， Trinity 等短序列比对软件： bwa ， bowtie ， tophat ， SOAPAligner 等局部比对软件：Blast ， blat ， CorssMatch 等多序列全局比对软件：Muscle ， clustalw 等基因预测软件：Glimmer ， GeneMark ， Augustus ， FgeneSH ， SNAP ， GeneScan ， EuGENE ， Glean等重复序列预测软件：RepeatMasker ， TRF等聚类软件：MCL ， hcluster_sg等统计软件：pLINK ， TASSEL ， R ， SPSS等...
进行生物信息学应该用什么软件？【生物信息学分析软件 生物信息学常用软件】你讲的是生物信息学的哪一方面？要是所有的常用软件 ， 建议你看看《生物信息学分析实践》这本书 ， 2010年科学出版社出版的图书 ， 由吴祖建 ， 高芳銮 ， 沈建国编著 ， 绿色封面 。里面有常用软件的用法及例子 ， 若是你要电子链接 ， 我这也有 ， 你可以留下邮箱 ， 我可以传给你 。如果你要是想问某一方面的软件 ， 我也可以给诉你的更详细些 ， 比如引物设计、蛋白质二级三级结构预测、基因注释分析以及RNA结构预测软件 ， 就是不知道你想要了解哪方面？

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